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吸附的第二步是二级吸附，一些人称其为化学吸附。在细胞与矿物间形成了一种特殊的联系。Arrendondo等人[23]认为，细胞壁上的蛋白质在这种联系中起着重要作用。Devasia等人[24]支持这种观点并认为在细胞表面存在的蛋白质是氧化亚铁硫杆菌吸附在硫化矿表面的原因。一些研究认为，在细胞与矿物表面之间发生了特别的生物化学反应，但这些都尚未被鉴别出。对吸附了的细菌的矿化物表面的电子显微照片观察表明，大多数细菌附着在可见的晶体表面缺陷处。
人们通过多种方法对吸附行为进行了研究并提出各种观点，但Sampson[25]等人总结了微生物吸附到矿物的作用方式，其中涉及到微生物表面分泌的粘液层、结合蛋白质受体、多糖蛋白质复合物和菌毛等。由于细菌表面成分十分复杂，它们的物理、生物和化学性质直接影响着细菌吸附至矿物表面。
1.4.3 浸矿细菌的氧化途径及浸出机理
嗜酸细菌主要用于硫化矿浸出实验的研究，浸出机理就取决于硫化矿物的性质—被浸出的矿物是酸可溶性的还是酸不溶性。黄铁矿、辉钨矿这些硫化矿物为酸不溶性矿物，根据分子轨道和动力学计算，这些酸不溶性硫化矿只能被Fe3+离子而不是氧气的氧化作用侵蚀分解。具体被氧化的途径为:三价铁离子的优尔水合物首先将黄铁矿中的硫离子氧化，从而侵蚀破坏晶格中的Fe-2S化学键，分解产物是硫代硫酸盐和亚铁优尔水合物;然后硫代硫酸盐依次被循环氧化分解为连四硫酸盐、双磺-单磺酸、连三硫酸盐和硫代硫酸盐。在整个氧化过程中产生有少量的中间产物元素硫和连五硫酸盐。因黄铁矿浸出的重要中间产物是硫代硫酸盐，所以其浸出机理被称为硫代硫酸盐途径[26-27]。
因此，当最初的溶液中没有Fe3+存在，则只能通过A.t表面的Fe3+将其氧化，然后Fe2+和硫代硫酸盐被释放出来，硫氧化细菌A.thiooxidans将硫代硫酸盐氧化成硫酸。而黄铜矿、闪锌矿、方铅矿、砷黄铁矿这些酸可溶性矿物在酸性条件下可以通过质子攻击或Fe3+作用而溶解，Me-S键直接被破坏，二价的金属离子、硫酸和硫化物阳离子分别溶解出来，并进一步将形成的多硫化物和多硫化物氧化成元素硫。
铜溶剂萃取过程中的夹带现象是普遍存在的恶化作业状况的棘手问题，是造成操作成本升高、环境污染的主要原因。在国内外铜溶剂萃取技术的应用研究中，对夹带现象的研究是一个薄弱的环节。要消除或控制铜溶剂萃取夹带现象，迫切需要对夹带产生的原因、规律和稳定机理有深入的了解，这是夹带防治的首要步骤。因此，对铜溶剂萃取作业中夹带现象的研究不仅可以节约原料减少成本，对浸出环境保护也有积极的作用。
1.5 研究的目的、意义
生物浸铜一溶剂萃取一电积整个过程，是将铜矿石在细菌中进行酸性浸出，然后用铜萃取剂从浸出液中选择性地萃取出铜，再通过反萃取将铜富集达到满足电积要求的电解液，最后电积生产出高纯度的阴极铜，工艺流程如图１所示，而在萃取过程中通过溶解、夹带等途径，流失于萃余液的有机相通过循环进人浸出体系，有机相中含有许多杀菌剂和多种表面活性物质，这些毒性物质使细菌活性降低，这将必然会给细菌的浸矿效率带来负面影响。因此针对铜萃取有机相对生物浸出过程影响，展开一系列对A.t菌在不同矿物表面吸附行为的研究，阐释铜萃取有机物对A.t菌浸铜过程的影响机理。