表2 167个卤代烃的实验值与计算值 26
表3 54个芳香烃的实验值与计算值 31
表4 158个烷烃与环烷烃的实验值与计算值 32
表5 55个醇、酚、醚的实验值与计算值 37
表6 79个烯烃的实验值和计算值 39
表7 41个炔烃的实验值与计算值 41
表8 47个含N有机物的实验值和计算值 42
表9 83个含S有机物的实验值与计算值 44
变量注释表
价电子数
hi 与原子i成键的氢原子数
原子i的电子数
原子价轨道电负性
分子连接性指数的指数的阶
同种分子碎片的数目
简单原子点价
分子碎片的类型
引 言
在有机物定量构效关系(QSPR)的研究中,拓扑指数法是一种最为普遍的研究方法,这是因为任何物质的理化性质、生物活性都和其分子内部的结构有必然联系,所以为了实现结构与性质之间的定量描述,必须要使分子结构数量化[1]以使研究方便快捷。拓扑指数是一种用来表现分子拓扑图某种特征的不变量,通过从分子图中提取出这种分子结构特征的不变量来区分分子结构信息数值化。这种方法比较全能,并且不受实验和经验的限制,所有化合物都可获得拓扑指数,使得其中有计算简单、应用方便等特点;所以可以采用计算机的程序化设计对大批量的数据进行处理,这在物质构效关系(QSPR/ QSAR) 的研究中发挥了重要作用。论文网
目前最广泛使用的是拓扑指数是化学家Wiener于1947年提出的Wiener[2]指数,其它报道的拓扑指数已达200余种,在这里面最著名的是Randic连接性指数[3]和Kier-Hall指数[4,5]。它们多以有机化合物为研究对象,通过化合物中的分子结构来描述和预测它们的理化性质和相关的生物活性。其中常用的拓扑指数有4种分别为分子连接性指数、分子价连接性指数、电拓扑状态指数和Kier形状指数。在这些研究中认为拓扑指数是“经典”的分子描述符,并且该指数已经在文献中有明确的定义,但这些“经典”的拓扑指数,主要是为了满足某一特定的QSPR/QSAR模型建立的研究,因此不能保证有效地预测物质的其它性质或活性。所以,我们要对原有的拓扑指数进行修正,修正的过程通常有两种方法[10]:一种是在原有拓扑指数的基础上进行“静态”修正;另一种是用可变因子来代替原有拓扑指数中的某些常量。本文将采用第二种方法对Kier-Hall指数进行改进,并通过这一方法提高多类有机物标准熵模型的相关性。
标准熵是与分子结构密切相关的物理量,它是一个热力学和化学名词;指在标准状态下,1摩尔纯物质的规定熵。影响标准熵的因素有:(1)化合物中分子大小,分子中所含原子数越多,熵值增加;伴随着原子序数变大,熵值就越大;(2)如果是同分异构体,分子结构对称性高的异构体的熵值小于对称性低的异构体。分子结构的对称性越高,分子结构的有序性程度越大,如果分子的混乱度变大,相应熵值随之变大;(3)对于同碳数的烷、烯、炔,熵按照此顺序序递减。总的来说体系混乱度是影响标准熵最重要的因素。文献综述