具体来说，使用 Blast工具，通过局部寻优的方法得 到每个氨基酸进化为 20 种常见氨基酸的可能性大小，可以得到 PSSM：

1。获取最新的蛋白质序列数据库 uniprot_sprot。fasta。gz（； 2。格式化 db：makeblastdb -in uniprot_sprot。fasta -dbtype prot -parse_seqids -out db的名字；