3。1。1 RNA 的属性参数 7

3。1。2 RNA 样本表示 9

3。1。3结果评测 11

3。1。4 实验结果及对比 12

3。1。5 本节小结 13

3。2 基于相关系数方法的 RNA 甲基化识别 13

3。2。1 简介 13

3。2。2 RNA 样本建立 13

3。2。3 AC 与 CC 算法 14

3。2。4 本节小结 19

3。3 Auto-cross covariance 方法 20

3。3。1 方法简介 20

3。3。2 实验内容及结果 20

3。3。3 本节小结 22

3。4 本章总结 22

第四章 实验结论与分析 23

4。1 结果对比 23

4。2 结果分析 23

结 语 24

致 谢 25

参 考 文 献 26

第一章 绪论

1。1 研究背景及意义

RNA 在生物学系统中有着举足轻重的作用，它不但将 DNA 的遗传信息传递给蛋 白，同时也负责调控各种生物学过程。RNA 上有一百多种化学修饰，但绝大多数修饰 的功能还不为人知。人们一般认为 RNA 的寿命很短，其上的化学修饰是静态的，一旦 形成就不可改变。然而自从科学家们在 2012 年首次发现了一种可逆性的 RNA 甲基化

——m6A 后 ，研究有了新的突破。RNA 的甲基化发生在腺嘌呤的第六个氮原子上，如 图：

图 1-1 可逆 RNA 甲基化-m6A

大家都知道，在真核生物中，m6A (N6-Methyladenosine)是在 RNA 分子中最常见的 和最丰富的，超过 80%的 m6A 是以 RNA 甲基化的形式存在于不同的物种。m6A 主要 分布在 mRNA 中，也发生在非编码 RNA 如 tRNA，rRNA 中。由于 m6A 的数量很丰富， 在 mRNA 转录中，m6A 对于核糖核苷的生物进程具有很大的影响，比如 RNA 的拼接, 核糖核苷的转移，遗传信息的翻译以及遗传物质的稳定性，RNA 转录过程等。m6A 的 甲基化水平异常时，常常会导致某些关于 RNA 功能障碍的疾病发生。比如，m6A 的甲 基化水平异常低于正常水平时，由于会使生物的 FTO 水平异常甚至导致 FTO 基因突变， 从而使得肥胖、癌症以及相关疾病的发作。由此可见动态和可逆甲基化化学修饰 m6A 对 于我们的重要性。因此，更多的有用的信息，更好理解 m6A ，RNA 甲基化水平和分布 对 RNA 的转录、疾病的诊断和治疗非常有益。论文网

1。2 国内外研究现状

虽然在 19 世纪 70 年代就已经有三个国家的生物学家们确认了 mRNA 上面的修饰——m6A 的存在，这种修饰非常普遍，但是人们一直不清楚这种修饰有何功能。直到

2012 年科学家们发现了 m6A 的修饰是可逆的，引起了人们对于 RNA 甲基化识别的关 注。作为一个新兴的研究领域，科学家们对此投入了极大的精力，花费了大量时间去 探寻，也使得 RNA 甲基化识别技术蓬勃发展。