一、课题的任务内容：对埃切毕赤酵母的醇脱氢酶进行同源建模和分子对接二、原始条件及数据：

实验室配置了2台戴尔高性能工作站，专门用于生物信息学计算，可以进行生物大分子的模拟、通过其3D结构进行蛋白质的同源建模、分子对接，以便进一步研究酶的催化机理，为半理性筛选目的基因及其对酶进行改造奠定基础。78844

三、设计的技术要求（论文的研究要求）：

1、学会使用NCBI、PDB数据库

2、对序列比对、同源建模、分子对接有一定了解。

四、毕业设计（论文）应完成的具体工作：

1、熟悉使用NCBI、PDB数据库

2、熟练掌握同源建模和相关的分子模拟技术

软硬件名称、内容及主要的技术指标（可按以下类型选择）：

计算机软件 Sybyl2。0

图      纸

电  路  板

机 电 装 置

新材料制剂

结 构 模 型

其      他

五、查阅文献要求及主要的参考文献： 论文网

1。 沈伟艺, 沈钟城, 胡峥, 林勇利, 王均明。 (S)-1-叔丁氧羰基-3-羟基哌啶的合成[J]。 中国医药工业杂志, 2013,5: 436-438。

2。 竺伟, 王波, 吴会, 李兵豪等。 (S)-1-叔丁氧羰基-3-羟基哌啶的化学-酶法合成[J]。 中国医药工业杂志, 2015, 46(4)。

3。Xin Ju, Junhua Tao, et al。 Development of a Biocatalytic Process to Prepare (S)-N-Boc-3-Hydroxypiperidine[J]。 Organic Process Research & Development。 2014, 18: 827−830。

4。Zhu Wei et al。 Preparation of (S)-N-tert-butoxycarbonyl-3-hydroxypiperidine with immobilized whole cell[P]。 中国, 104059952。 2014-09-24。

5。Trevor M。 Penning。 The aldo-keto reductases (AKRs): Overview[J]。 Chemico-Biological Interactions。2014。

6。 欧阳芳平,徐慧,郭爱敏等。 分子模拟方法及其在分子生物学中的应用。生物信息学,2005。

7。朱伟平。 分子模拟技术在高分子领域的应用。 塑料科技, 2002。5。

8。Lei Huang, Hong-Min Ma, Hui-Lei Yu, Jian-He Xua。 Advanced synthesis & catalysis[J], Altering the Substrate Specificity of Reductase CgKR1 from Candida glabrata by Protein Engineering for Bioreduction of Aromatic α-Keto Esters。 2014, 356, 1943–1948。

六、进度安排：（设计或论文各阶段的要求，时间安排）：

1-3周：查阅文献，撰写开题报告；4-5周：在研究生指导下，熟悉数据库的查阅； 6-8周：序列比对；9-12周：同源建模； 13-16周：分子对接； 17周：整理实验数据，撰写毕业论文，准备论文答辩； 18周：毕业论文答辩。