本研究以抗盐型品种‘阳江’狗牙根为材料,以前期通过cDNA-AFLP技术获得的部分CdCLCc序列(包括3’端)为基础,克隆其全长序列,并进行盐胁迫下荧光定量表达分析和生物信息学分析。本研究不仅可以进一步理解狗牙根抗盐(氯)机理,为抗盐性持续改良提供实验依据,同时也有利于抗盐植物中的抗盐基因挖掘,为其他抗盐性差的植物提供优质的关键抗盐基因。
2 材料和方法
2。1 植物材料
以前期实验筛选出的抗盐型品种‘阳江’狗牙根和敏盐型品种‘南京’为材料[13],其中‘阳江’狗牙根叶色深绿,匍匐性强,密度高,成坪快,草层厚,耐践踏性强,抗盐很好,能够在重度盐碱地形成较高质量的草坪。文献综述
2。2 植物材料RNA提取
采用EASYspin植物RNA快速提取试剂盒(原平皓(天津)生物技术有限公司)提取材料的RNA,具体步骤如下:
1)取干净的‘阳江’狗牙根叶片,在液氮环境下将植物材料迅速研磨成粉末,加入500微升SL(使用前需加入β-巯基乙醇),立即震荡混匀,12000rpm下离心2min。
2)将上清液转移至过滤柱CS(过滤柱CS置于收集管中),12000rpm离心2min,小心收集上清液至新的RNase-Free的离心管中,吸头要避免接触管底的细胞碎片沉淀。
3)缓慢加入200 µL的无水乙醇,混匀,将得到溶液一起转入吸附柱CR3中,12000 rpm离心15 s,弃去收集管中废液,将吸附柱CR3重新放入收集管中。
4)向吸附柱CR3中加入350 µL的去蛋白液RW1,12000 rpm离心15 s,弃去收集管中上清液,将吸附柱CR3重新放回收集管中。
5)向吸附柱CR3中加入80 µL的DNase I 工作液,室温15min。
6)向吸附柱CR3中加入350 µL的去蛋白液RW1,12000 rpm离心15 s,弃去收集管中上清液,将吸附柱CR3重新放回收集管中。
7)向吸附柱CR3中加入500 µL的漂洗液RW(使用前加入乙醇),12000 rpm离心15 s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR3重新放回收集管中。
8)再将此步骤重复一次后,12000 rpm离心2 min,将吸附柱CR3放入一个新的RNase-Free离心管中,向中间部位悬空滴加40 µL RNase-Free ddH2O放室温2 min后,12000 rpm离心1 min,得到RNA溶液。
2。3 RNA质量检测
称取0。25 g琼脂糖,加入25 ml缓冲液,微波炉加热至融化,等微热后加入2。5 µL核酸染料EB,倒入模具中制成电泳需要的胶。吸取RNA溶液2 µL加入1 µL loading buffer,混匀后用移液枪点样到胶孔中,其中第一孔点Marker,然后120V恒压跑胶15-20 min,取出胶块放入凝胶成像仪中观看拍照。
2。4 mRNA反转录合成cDNA
I cDNA第一链合成(使用Takara cDNA第一链合成试剂盒)
GSP1作为引物(取代OligoT),引物浓度为50μM,反转录温度采用50℃(试剂盒为42℃)
II反转录产物纯化(使用Takara MiniBEST DNA Fragment Purification Kit)
1)室温, 结合溶液binding solution来,自,优.尔:论;文*网www.youerw.com +QQ752018766-
2)100μl ddH2O, 65℃预热
3)加入120μl binding solution (6M NaI)至第一链反应液中
4)将cDNA/NaI 加入S。N。A。P柱中,13000g离心20s
5)将滤液转至小离心管中(保存滤液直至cDNA都确定回收),将纯化柱重新置于离心管中
6)加入0。4ml 预冷(4℃)1Xwash buffer,13000g离心20s,弃滤液,重复3次
7)加入0。4ml 预冷(4℃)70%酒精,13000g离心20s,弃滤液,重复2次
8)13000g离心1min,将纯化柱放入新离心管
9)加50ul预热(65℃)ddH2O,13000g离心20s,洗脱