摘要:GRAS家族是一类植物特有的转录因子,研究证明该家族基因在植物根的发育、分生组织的形成、赤霉素信号转导、雄配子发育以及光信号转导过程中具有重要的作用。本研究主要分析短柄草中GRAS家族的基本生物学信息,通过序列比对,蛋白分析,染色体分布以及物种之间的比较,来综合探讨GRAS家族在短柄草中基本生物学功能,为基因的功能研究奠定基础。81947
毕业论文关键词:GRAS家族,转录因子,短柄草,生物学功能
Abstract:GRAS family is a kind of plant specific transcription factor, studies have shown that the family genes in plant root development, the formation of the meristem, gibberellin signal transduction, male gametogenesis and light signal transduction plays an important role in the process。 This study mainly analyzes the basic biology of small GRAS in the grass family information, through sequence alignment and protein analysis, comparison between chromosome distribution and species, to explore GRAS family basic biological functions in short grass, lay the foundation for gene function research。
Keywords:GRAS family, transcription factor , brachypodium distachyon, biological functions
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目录
1 前言 5
1。1 转录因子的概念及结构 5
1。2 GRAS基因家族的概念及结构特征 6
1。3 短柄草的基本信息 8
1。4 短柄草的生物信息学研究进展 8
1。5 研究短柄草中GRAS转录因子家族的目的和意义 8
2 材料与方法 9
2。1 数据的搜集 9
2。2 GRAS基因家族成员的鉴定以及其保守结构域的鉴定和分析 9
2。3 蛋白保守序列的比对和GRAS蛋白系统进化树的构建 9
2。4 GRAS基因家族所在染色体区段在不同物种中的复制分析 9
3 结果与分析 9
3。1 短柄草GRAS转录因子家族的鉴定 9
3。2 短柄草GRAS基因家族的进化分析以及不同物种的GRAS基因家族综合进化分析 13
3。3 短柄草GRAS家族蛋白结构域分析 15
3。4 短柄草GRAS基因家族的染色体分布 16
3。5 GRAS基因家族在短柄草分别与水稻、高粱和玉米之间染色体复制情况的分析 17
结论 20
参考文献 21
致谢 23
1 前言
1。1 转录因子的概念及结构
在分子生物学中,转录因子,它还有一个别称叫做反式作用因子(分子间作用因子),一种可以与基因上游特定的核苷酸序列结合的蛋白质,这些蛋白质能调控其基因的转录。转录因子可以调节核糖核酸聚合酶(核糖核酸,核酸酶)与核酸模板的结合。植物的转录因子分为两种,包括非特异性转录因子和特异性转录因子。转录因子不仅能够构成转录因子复合体,该复合体是和其余转录因子结合的,其作用是用来影响基因的转录,还可以联合启动子区域,该启动子区域在基因上游。转录因子占植物特异蛋白质中的13%论文网。转录因子能够依据其DNA结合域特征分成若干个家族。