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两面针根和根皮中所含化学成分复杂主要含有苯并菲啶类生物碱(目前已报道的有30余种)、黄酮类、木脂素类、香豆精类分、甾醇等，并有Zn,Cu,Fe,Ca,Mn,Mg等微量元素[11]。从两面针根中分离生物碱，氯化两面针碱的得率最高。黄治勋用95%乙醇温萃取，干燥后取滤液旋蒸得深褐色稠膏状固体。此膏用5%乙酸反复捏溶，抽滤取滤饼，滤饼用95%乙醇洗涤多次，得青黄色固体。将此固体溶解于40℃水中，加入氨水使混合液体呈碱性，加入氯仿萃取。回收氯仿，残留物溶解于盐酸中，放置一昼夜后析出粗结晶体。将粗结晶溶解于热甲醇中，加入活性炭脱去色素，水浴反应回流后趁热过滤，取滤液置于60℃保温瓶中结晶，析出黄色针状结晶体。过滤取结晶体，溶解于甲醇中采取重结晶操作，得到氯化两面针碱。用此方法从两面针根中分离得氯化两面针碱的收率为0.149%。
王玫馨的提取方法略有不同[12]。用甲醇加热回流下提取，减压回收为原量的1/4，得到稠膏状固体为黄绿色。加入氯仿反复研磨，所得沉淀溶解于甲醇红，加盐酸调节pH=2，静置一段时间后析出固体为淡绿色的针状结晶，即氯化两面针碱。用此种方法从广州地区产的两面针根皮中分离得含量高达0. 2%-0.3%的氯化两面针碱[13]，溶点276-277.5 ℃，硅胶CMC薄层层析Rf = 0.36，绿色荧光，显色后呈棕黄色。所测得的紫外光谱、红外光谱与黄治勋的结果基本一致。核磁共振谱与文献结果一致。
雷鹏等采用正交平行实验法[14]，以氯化两面碱的溶解率作为指标，对两面针的提取工艺进行优选。发现用水提取两面针，氯化两面针碱的溶解率相当低，不到30%；而用乙醇提取，氯化两面针碱的转移率可达70%，故确定提取溶剂采用乙醇[15]。选择乙醇浓度、溶剂用量、提取时间3个因素，每个因素设3个水平。正交平行实验结果表明，最佳提取工艺条件是用60%乙醇溶液提取2次，每1次9倍量，提取2 h;第2次7倍量，提取l.5 h。另外对药材形态也进行了考察，发现用丁状小块药材(约为1 cm3 )进行提取效果最好，提取2次，相对转移率可达90%。雷鹏等测得药材中氯化两面针碱的平均含量为0. 236%。