目前,转座子随机诱变技术是发掘已知基因新功能、发现新基因等研究的有效途径之一。转座子随机诱变技术是将转座子引入细菌染色体中,在细菌基因组中随机插入某些基因,使靶点处的基因失活,得到大量基因突变株,从而构建出突变体文库,从其中筛选表型发生变化的突变株,进一步研究与该表型相关的被失活基因的功能[8]。
本研究利用转座子随机诱变技术构建猪链球菌2型ZY05719菌株转座子突变体文库,通过人脑微血管内皮细胞(hBMEC)侵袭试验筛选出侵袭能力减弱的突变株,进行反向PCR并测序,对比分析后鉴定出各SS2突变株的沉默基因,为进一步研究SS2侵袭能力相关基因及其功能提供参考。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 菌株、质粒和细胞
猪链球菌2型野生型菌株ZY05719,于2005年四川猪链球菌2型疫情中由本实验室分离鉴定并保存。大肠杆菌购自天根生化科技(北京)有限公司。质粒pMar4s由本实验室构建并保存。人脑微血管内皮细胞(hBMEC)购自南京科佰(Sciencell)生物技术有限公司。
1.1.2 引物、试剂和仪器
试验所用引物(表1)由南京金斯瑞生物科技有限公司合成。
表1 实验所用引物
Table.1 Oligonucleotide primers used in this study
引物 序列[5] (5'–3')a 功能
oITR cccctgcagTAACAGGTTGGCTGATAAGTCCCCGGTCT TnYLB-1 design(PstI)
oIPCR1 GCTTGTAAATTCTATCATAATTG IPCR amplification
oIPCR2 AGGGAATCATTTGAAGGTTGG IPCR amplification
注:引物中的酶切位点由下划线标出。Restriction sites in primers are underlined.
THB购自美国BD公司;卡那霉素(Kanamycin,Kan)、壮观霉素(Spectinomycin,Spc)、庆大霉素、青霉素购自Sigma公司;Taq I酶,T4 DNA连接酶,2× PrimeSTAR HS (Premix),DL2000 maker、DL5000 maker、DL15000 maker,TaKaRa MiniBEST DNA Fragment Purification Kit试剂盒购自大连Takara生物工程有限公司;2 × Taq Master mix购自南京诺唯赞生物科技有限公司;Tiangen细菌基因组DNA提取试剂盒购自天根生化科技(北京)有限公司;Omega Plasmid DNA Mini Kit试剂盒,Omega Gel Extraction Kit试剂盒购自Omega公司;核酸染料GoldViewTM购自北京赛百盛基因技术有限公司;FBS购自Gibco公司;DMEM购自HyClone公司;其它试剂均为国产或进口分析纯。
仪器设备:
GRP-9270型 隔水式恒温培养箱,上海森信仪器有限公司;
THZ-25 大容量恒温振荡器,太仓市华美生化仪器厂;
Thermo SCIENTIFIC LEGEND MICRO 17 微型离心机,赛默飞世尔科技公司;
Thermo SCIENTIFIC Fisher 高速冷冻离心机,赛默飞世尔科技公司;
BECKMAN COULTER Avanti J – 30I 离心机,贝克曼库尔特商贸(中国)有限公司;
Eppendorf 5415R 低温微型离心机,德国艾本德公司;
Eppendorf 5415 常温微型离心机,德国艾本德公司;
Eppendorf basic 紫外可见光分光光度计,德国艾本德公司;
BIO – RAD GenePulser XcellTM电穿孔系统,伯乐中国公司;
Thermo SCIENTIFIC SHKE6000-8CE 低温摇床,赛默飞世尔科技公司;
Eppendorf PCR仪,德国艾本德公司;
JS-Power 600电泳仪,上海培清科技有限公司;
BIO – RAD Gel DocTM XR+ Molecular Imager凝胶成像系统,伯乐中国公司;
Thermo NanoDrop 2000微量分光光度计,赛默飞世尔科技公司;
XMTD-204恒温水浴锅,NUOHAI公司;
Thermo BB150二氧化碳培养箱,赛默飞世尔科技公司;
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