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（三） 中小企业不相容职位没有分离
出纳人员一人管钱又管往来账，办理货币资金业务的全过程都由一人办理，支付款项所需的全部印章都由一人保管，这会导致公司钱财被擅自挪用，产生私设“小金库”，账外设账，收款不入账的现象。
例如：王某在某民营企业担任出纳员兼任金库保管员，2009年6月2日，王某偷偷从金库中取出2006年国库券10万元，4个月后，王某见无人知晓，胆子开始大了起来，又取出10万元，通过证券公司融资回购方法，折借人民币29万元，用来炒股，没想到赔了钱。王某在无力返还单位债券的情况下，将金库里剩余的20万元国库券全部取出后潜逃。这家民营企业存在的问题是财务不兼容职务没有分离，出纳不可以负责保险柜或金库的钥匙，应由主管负责。
（四） 中小企业会计人员素质偏低
由于中小企业对会计人员要求低，所以存在会计人员无证上岗的现象，会计机构负责人不具备会计师以上专业技术职务资格或者从事会计工作3年以上经历，这会使企业会计信息质量低下。中小企业不重视对会计人员的培训，使得他们的思想教育，职业道德规范教育，业务培训都远远跟不上会计行业的发展，无法提高会计人员素质，无法警示会计人员的行为。
部分中小企业的会计人员只懂简单的会计常识，而缺乏管理知识，无法参与管理，在成本控制上提出建设性的意见。
（五） 会计账目管理混乱
有的中小企业为了满足个人利益或企业利益，将往来科目当做调节利益的科目，将潜盈，潜亏项目以各种名目长期挂入往来科目不作处理；有的对外投资项目由于被投资企业破产倒闭，已完全不可能收回投资，也挂往来科目；债权债务中有的明细科目几年都没有变化，也不根据年限做相应调整和处理，这些做法导致账务严重不实。