摘要：SBP基因家族是植物中特有的一类转录因子家族，广泛的参与植物生长发育及多种生理生化过程。本文通过生物信息学方法，对水稻SBP转录因子的保守结构域、系统进化关系、在不同组织中表达情况以及其根茎组织对不同激素的响应进行了分析，并从水稻与短柄草、大豆、玉米的SBP基因组重复比对结果入手，分析了四种植物间的同源性关系。在对水稻以及水稻和其他物种之间基因的线性关系分析后，显示水稻和其他的物种之间有大量的同源基因，而在水稻中SBP转录因子家族在花器官的生长和发育中发挥重要作用，从而为进一步研究水稻SBP基因家族的结构与功能提供帮助。93921

毕业论文关键词：水稻，SBP基因家族，转录因子，生物信息学

Abstract: SBP gene family is a unique family of transcription factors in the family, extensive participation in plant growth and development and a variety of physiological and biochemical processes。 In this paper, the bioinformatics method was used to analyze the conserved domain, phylogenetic relationship, the expression of different tissues and the response of rhizome to different hormones。 The results showed that the expression of SBP transcription factors, The SBP genome of maize was compared with the results, and the homology relationship among the four plants was analyzed。 After analyzing the linear relationship between rice and rice and other species, it shows that there is a large number of homologous genes between rice and other species, and that the family of SBP transcription factors in rice plays an important role in the growth and development of floral organs and to help to further study the structure and function of rice SBP gene family。

Keyword: rice, SBP gene family, transcription factors,bioinformatics

目   录

1  引言 3

1。1  转录因子概念 4

1。2  SBP家族的起源与进化 4

1。3  植物SBP基因家族的结构特征 4

1。4  植物SBP基因家族的生物学功能 4

1。5  研究意义 5

2 材料与方法 5

2。1  SBP转录因子的数据获取与分析 5

2。2  水稻SBP转录因子家族基因的在线分析 6

2。3 水稻SBP蛋白系统发生的进化树构建 6

2。4 水稻SBP基因家族不同组织的表达分析 6

3  结果与分析 6

3。1  水稻 SBP家族转录因子的鉴定与分析 6

3。2  SBP转录因子家族基因的进化分析 8

3。3 水稻SBP基因的保守基序分析 10

3。4  水稻SBP基因的组织表达分析 12

参考文献 16

致  谢 19

1  引言

1。1  转录因子概念源C于H优J尔W论R文M网WwW.youeRw.com 原文+QQ752-018766

转录因子（反式作用因子），是一种特别的DNA结合蛋白，能够直接的与真核基因启动子区域结合，或者特异性地通过顺式作用元件结合于基因启动子区域，在转录的过程中起到激活子或抑制子的作用，调控基因的表达[1]。转录因子在植物的生长发育以及响应环境胁迫过程中发挥着重要作用。典型的转录因子功能域一般包括四种[2]：DNA结合域（DNA—binding Domain）、转录调控域(Transcription Regulation Domain)、寡聚化位点(Oligomerizationsite)和核定位信号区(NLS，Nuclear Localization Signal)。但不是所有的转录因子同时都具有这四种结构域，有些基因会缺失某一种结构域[3]。在植物中存在的转录因子家族约有60多个[4, 5]，根据DNA结合域的特点可分为： WRKY、AP2/EREBP、NAC、MYB、MADS、SBP等。