裸子植物云杉GDU蛋白异常扩增与进化分析(5)
PaGDU46 MA_69823g0010 MA_69823:2413-2790 378 1 1(35-57)
PaGDU47 MA_70871g0010 MA_70871:4485-4814 330 1 1(20-42)
PaGDU48 MA_7105878g0010 MA_7105878:1-432 432 4 1(65-87)
PaGDU49 MA_780420g0010 MA_780420:2575-2961 287 2 1(46-68)
PaGDU50 MA_79500g0010 MA_79500:15622-15969 348 11 1(21-43)
PaGDU51 MA_8538472g0010 MA_8538472:60-410 351 1 1(37-59)
PaGDU52 MA_8817769g0010 MA_8817769:455-742 288 0 1(21-43)
PaGDU53 MA_8869g0010 MA_8869:41381-41731 351 12 1(20-42)
PaGDU54 MA_890390g0010 MA_890390:1471-1848 378 0 1(15-37)
PaGDU55 MA_8983981g0010 MA_8983981:1-1718 1718 1 1(30-52)
PaGDU56 MA_9025515g0010 MA_9025515:893-1246 354 8 1(27-49)
PaGDU57 MA_91090g0010 MA_91090:17920-18198 279 5 1(20-42)
PaGDU58 MA_935479g0010 MA_935479:8916-9239 324 100 1(24-46)
PaGDU59 MA_9356847g0010 MA_9356847:1501-1821 321 6 1(26-48)
PaGDU60 MA_956097g0010 MA_956097:1-1381 1381 4 1(20-42)
PaGDU61 MA_9832g0010 MA_9832:5296-5598 303 3 1(20-42)
PaGDU62 MA_9836g0010 MA_9836:36982-37320 339 23 1(21-43)
PaGDU63 MA_99763g0010 MA_99763:11030-11377 348 4 1(20-42)
2.2 云杉及模式植物GDU家族基因的系统进化关系
为了了解云杉及模式植物GDU家族基因的系统进化关系，选取云杉、拟南芥和水稻等物种GDU家族基因中中的77个的基因。以这77个基因作为对象构建系统进化树[16]，如图2。通过对云杉及模式植物GDU家族基因的系统进化分析可以看出，GDU家族基因一共可分为5个类群分别命名为GroupⅠ~Ⅴ，每个类群分别以不同的颜色在进化树中标注[17]。从进化树图中可以看出GroupⅠ类群中包含6个基因，其中有云杉2个基因为PaGDU37和PaGDU27、拟南芥有1个基因AT5G38770、水稻3个基因为Os02g08170、Os02g09850 和Os02g42660[18]。GroupⅡ有18个基因大部分为云杉基因有16个，拟南芥只有一个AT3G30725基因[19]。Group Ⅲ类群有13个基因，云杉有5个基因，水稻有3个基因，拟南芥有5个基因。Group Ⅳ类群有9个基因，全部为云杉基因。Group Ⅴ类群有31个基因和GroupⅣ类群相同也全部为云杉基因。从中我们可以得知，Group Ⅴ类群所含基因数最多为最大类群，其次分别为Group Ⅱ类群、GroupⅢ类群、 Group Ⅳ类群 和Group Ⅰ类群。