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顺乌头酸酶基因的进化分析+文献综述(4)
2.1.4 动物
运用DNAstar分析动物中顺乌头酸酶基因及其所编码的蛋白,其数据如表4所示:
表4 动物顺乌头酸酶基因及其所编码的蛋白
Table 4 Animal aconitase gene and their encoding proteins data
基因 染色体定位 ORF(个数) 氨基酸个数 相对分子质量 PI 分子式
斑马鱼 gi|312144718 12, Zv9 c20215436-20202853
50 782 84859.6 7.58 C3754H5973N1057O1132S26
非洲蟾蜍 gi|510884120 Xtropicalis_v7 scaffold_4 74269577-74287341 87 781 85223.1 6.94 C3775H5990N1058O1135S27
猕猴 gi|109156579 10 85427381-85487709 319 780 85347.4 7.62 C3797H6018N1062O1127S24
小家鼠 gi|372099106 4 40143265-40199009 302 780 85463.5 8.08 C3795H6026N1068O1130S24
原鸡 gi|358485482 Z
70787483-70824265 174 785 85791.0 8.04 C3813H6043N1061O1132S29
白领姬鹟 gi|521280571 1A
c50116322-50092727 122 785 85775.1 8.32 C3809H6055N1059O1133S30
智人 gi|568815589 9 32384603-32450836
314 780 85425.4 7.36 C3769H6016N1064O1131S24
由表可知,斑马鱼顺乌头酸酶基因定位在12, Zv9 染色体上,编码区在c20215436-20202853,编码框50个,蛋白分子式为C3754H5973N1057O1132S26;非洲蟾蜍顺乌头酸酶基因定位在Xtropicalis_v7 scaffold_4 染色体上,编码区在74269577-74287341,编码框87个,蛋白分子式为C3775H5990N1058O1135S27;猕猴顺乌头酸酶基因定位在10染色体上,编码区在85427381-85487709,编码框319个,蛋白分子式为C3797H6018N1062O1127S24;小家鼠顺乌头酸酶基因定位在4染色体上,编码区在40143265-40199009,编码框302个,蛋白分子式为C3795H6026N1068O1130S24;原鸡顺乌头酸酶基因定位在Z染色体上,编码区在70787483-70824265,编码框174个,蛋白分子式为C3813H6043N1061O1132S29;白领姬鹟顺乌头酸酶基因定位在1A 染色体上,编码区在c50116322-50092727,编码框122个,蛋白分子式为C3809H6055N1059O1133S30;智人顺乌头酸酶基因定位在9染色体上,编码区在32384603-32450836,编码框314个,蛋白分子式为C3769H6016N1064O1131S24;动物中顺乌头酸酶基因编码的蛋白质的氨基酸个数在780左右,等电点在7.0~8.5之间,为中性蛋白。
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