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    本实验在大肠杆菌中对新型N-糖酰胺酶PNGase Stca进行重组表达,对其酶学性质进行探讨。试验结果将为N-糖酰胺酶的作用机制和N-糖酰胺酶分子定向进化等研究方向提供重要的科学基础和依据,进而为植物、昆虫糖组学N-糖链研究提供更经济实用的新工具,为动物细菌等生物的糖组学研究提供更多的选择。

    1  实验材料
    1.1  菌种
    Streptomyces cattleya
    1.2  主要试剂
    PNGase F,上海拜力生物科技有限公司;HRP(优尔根过氧化物酶),纯度RZ >3,南京都莱生物技术有限公司;RNase B(核糖核酸酶,纯度98%),Lactoferrin(乳铁蛋白,纯度98%),上海惠诚生物科技有限公司。
    Yeast extract(酵母提取物),Tryptone(蛋白胨),OXOID公司;Tris-HCl,Glycin(甘氨酸),北京博奥拓达科技有限公司;SDS,Agar(琼脂),IPTG(异丙基硫代半乳糖苷),Triton-X100,北京索莱宝科技有限公司;乙腈(分析纯),无水乙醇(分析纯),南京化学试剂股份有限公司;乙腈(色谱纯),Merck kGaA公司;冰醋酸(分析纯),NaCl(分析纯),Na2HPO4(分析纯),NiCl2•6H2O(分析纯),浓盐酸(分析纯),一水合柠檬酸(分析纯),广州华大化学试剂有限公司。PMSF(苯甲基磺酰氟),上海碧云天生物技术有限公司;咪唑(分析纯),上海安耐吉化学有限公司。
    所有实验用水均为超纯水。
    1.3  主要仪器设备
    日本Shimadzu LC-30AD超高效液相色谱配RF-20A/20Axs荧光检测器、SIL-30AC自动进样器、LC solution 工作站;
    M-6K微型离心机,杭州龙杨科学仪器有限公司;Hema 9600梯度基因扩增仪,Hema 16K台式离心机,Hema 1416R/ Hema TGL-16R高速冷冻离心机,珠海黑马医学仪器有限公司;NW Ultra-pure water system超纯水系统,力康生物医疗科技控股有限公司;立式压力蒸汽灭菌锅LDZX-75KBS,上海申安医疗器械厂;DYCZ-25D型双垂直电泳仪,北京市优尔一仪器厂;DGG-9140A电热恒温鼓风干燥箱,上海森信实验仪器有限公司;IMS-40型全自动雪花制冰机,常熟市雪科电器有限公司;DW-86L626海尔超低温冰箱,青岛海尔特种电器有限公司;HH-4数显恒温水浴锅,常州国华电器有限公司;ZQZY-T振荡培养箱,上海知楚仪器有限公司;CT15RT台式高速冷冻离心机,上海天美生化仪器设备工程有限公司;One Drop OD-1000分光光度计,南京五义科技有限公司;TS-200脱色摇床,其林贝尔仪器制造有限公司;FA2004分析电子天平(0.0001 g)及JA31002精密电子天平(0.01 g),上海良平仪器仪表有限公司;LNG-T120真空离心浓缩干燥机,太仓华利达实验设备有限公司;DRAGONLAB 大龙 MS-S磁力搅拌器,上海万岛仪器科技有限公司;PHS-3C型pH计,上海仪电科学仪器股份有限公司。
    多孔石墨碳柱(Supelclean™ ENVI-Carb™ SPE Tube),美国sigma公司。
    2  实验方法
    (一)PNGase Stca基因的合成与表达
    2.1  重组质粒的转化
    2.1.1  实验准备
    PNGase Stca基因的合成:通过生物信息学比对,找出与PNGase A基因具有相似性的PNGase Stca基因送至金斯瑞公司进行合成。
    LB液体培养基:称取5 g酵母提取物,10 g NaCl,10 g Tryptone(蛋白胨),溶解于900 mL 超纯水中,定容至1 L,121 ℃灭菌20 min。
    LB固体培养基:称取5 g酵母提取物,10 g NaCl,10 g Tryptone(蛋白胨),15 g Agar(琼脂),加热溶解于900 mL超纯水中,常温下定容至1 L,121 ℃灭菌20 min。
    Kana(卡那霉素)溶液:称取50 mg卡那霉素溶解于1 mL超纯水中,-20 ℃保存
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