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纵观国内外关于股权结构与研发投入关系的研究，学者们的观点莫衷一是，而且学者们基本从委托人与代理人的不同动机与行为逻辑出发，分析其对企业创新决策的影响，并形成相应的理论假说。学者们关于股权结构的讨论，主要集中在股权集中度、股权均衡、机构持股与股权性质方面。25183
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（一）股权集中度与研发投入
企业的资源是否适当的用于研发取决于对资源拥有控制权的主体的创新意愿，而这种控制权与企业的股权集中度联系紧密。股权集中度对企业研发投入的影响研究是最多、学者们观点分歧也最大的部分，现存研究有股权集中度与研发投入正相关、负相关、“U”型相关、倒“U”型相关、“N”型相关等结论；股权制衡作为股权集中的对立面，其对研发投资的影响有正面影响、无影响等。
1.股权集中度与研发投入正相关 论文网
持该观点的学者逻辑分析认为，当公司的股权分散时，存在股东与管理层之间的第一类委托代理问题。由于持有的股份所占比例较低，小股东们并没有足够的激励去督促管理层，小股东间存在“搭便车”的现象。由于创新研发不确定性大、收益在长期才能显现，管理层通常不愿意进行大规模的创新研发，尤其是风险规避型的管理层。而随着股权集中度的提高，大股东持股比例大，就会有动力监督、激励管理层去投资能提升企业未来价值的研发项目。论文网
杨勇，达庆利，周勤（2007）以2004年沪深两市江苏省具有省级以上技术中心的上市公司为样本，通过计量回归模型得出以公司前五位大股东所持股份比例的平方和表示的股权集中度对企业的技术创新有显著的正向作用；同时，三位学者强调，需注意 “一股独大”带来的公司管理中的效率丧失问题。
任海云（2010）通过单变量T检验与多变量回归模型，以A股制造业2004至2008年披露了R&D投入的企业为样本，分析得出第一大股东持股比例与企业R&D投入强度负相关，这说明一股独大不益于企业创新。而以前五大股东持股比例之和表示的股权集中度、股权制衡度与R&D投入关系显著为正，验证了好的股权结构同时需要多个大股东相互监督、制约，以缓解大股东治理的问题。
陈丽霖，冯星昱（2015）选取2009至2013年我国信息技术业上市公司为样本实证研究发现，以公司前五位大股东持股比例之和表示的股权集中度的提高有利于企业未来一期的研发投入。
Munjae Lee（2015）以2000至2012年间韩国医药制造业上市公司的非平衡面板数据为样本，研究发现，大股东持股比例与R&D投资之间存在显著的统计关系，大股东持有股份所占比例越高，企业R&D投入越高。
2.股权集中度与研发投入负相关
持有此观点的学者逻辑分析认为，在我国的上市公司中，“一股独大”与股权集中度高是很常见的现象，存在大、小股东之间的二类代理问题。大股东可能会利用自己在公司的治理地位牟取私利、侵占小股东的权益，进行利益输送、关联交易等行为而无意愿从事研发投资。同时，在股权集中的情况下，大股东持股比例高，无法分散风险，进行不确定性高、规模大、周期长的研发投入将面临很大风险，因此大股东们对于创新研发决策非常谨慎，那么股权集中度就应和研发投入显著负相关。股权制衡在此情况下被视为有效解决该问题的途径，所以股权制衡应与研发投入显著正相关。
杨建君，盛锁（2007）通过分析由问卷调查收集整合来的数据发现企业的股权越集中，创新投入就会越低，且该负相关关系在技术创新风险越大时越显著，两位学者认为这一关系与股东风险规避的心理因素有关。