王锡爵首肯“三王并封”给他的政治生涯带来了诸多争议，饱受朝中诸臣的指责。东林党人顾宪成指责王锡爵“排群议而顺上旨”，认为“三王并封”是万历皇帝听信王锡爵的请求而提出的，批判王锡爵是为了博取宠爱的“谀臣”，没有及时纠正皇上的错误，身为元辅有愧于天下；朱维京批评王锡爵没有再三请求皇帝收回成命，难以使众人心服；高攀龙批评王锡爵一意孤行，不听朝臣劝告。一时之间，王锡爵成为了朝中大部分人攻讦的对象。面对言官的指责，王锡爵开始在擅权与庸碌之间游离，上疏自劾并且请求罢免，并在万历二十一年（1593年）二月请求万历皇帝收回“三王并封”的诏令。万历皇帝迫于各方压力，只好同意放弃“三王并封”的诏令。

虽然“三王并封”事件就此平息，但是言官对于王锡爵的质疑声没有因此减少。在这样的舆论压力之下，加上目、胃二疾的身体折磨，深受“以道事君，不可则止”思想灌输的王锡爵，于同年三月初四就递上了第一封因病乞归的奏疏，此后一年多的时间里，连续上疏八次乞归，在奏疏中痛陈自身病情的变化。深入解读这八份奏疏，有助于研究万历皇帝与王锡爵之间融洽的君臣关系，君主依赖、信任臣子，臣子为国家忠心耿耿，同时也能看出王锡爵是一个执着、孝顺、大公无私和忧国忧民的人，有利于对王锡爵的人物研究。