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诺如病毒GⅠ、GII型流行株基因组特征分析及进化机制研究(4)
GII.4型诺如病毒在宿主免疫压力下通过不断突变和基因重组保持快速进化,这被认为是促进GII.4型诺如病毒在二十年来持续流行的原因。疫情监测显示出诺如病毒具有与流感病毒相似的流行模式,抗原变异株每隔几年就会出现并暴发。进化过程中积累突变造成抗原位点区域的多样性,从而逃避厡流行株引起的宿主免疫保护作用[10]。由于若如病毒的基因组拥有多种亚型,加上由于外界环境因素以及药物的影响,为诺如病毒的基因组突变创造了一定条件,诺如病毒在日后可能还会进化出更多的亚型。这样看来,人类与诺如病毒的对抗还有很长的一段路要走。
1.7 系统发生树
系统发生(phylogeny)是指一群有机体发生或进化的历史。系统发生树(phylogenetic tree,又称evolutionary tree进化树)就是描述这一群有机体发生或进化顺序的拓扑结构[11]。它可以用来研究不同物种间的进化关系,这一直是
生物
学的研究热点之一。
随着人类基因组计划的完成,大量的分子数据不断涌现,刺激了分子生物学的飞速发展。这个崭新的时代又赋予了种系发生树新的意义。除了对地球上物种的进化史的研究,进化树的研究还有更多更加重要的意义。它有助于了解病毒传播的方式。通过构建系统发生树能确定各种病毒之间的关系,有一些序列比对算法要依赖于进化树,所以它可以帮助科学家更好地比对蛋白质和DNA序列;有助于基因功能的研究,基因功能的预测往往是由于从该基因的进化史中提炼得到的,知道在一个机体中一个特定基因的功能对于在与该机体亲缘关系紧密的机体中的相似基因的意义的了解非常重要。进化树可以很好的研究进化,告诉我们一些进化机制以及不同的进化事件以及其产生的原因
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