PCR扩增:10μL的反应体系(如表1),即提取好2μL DNA,2μL SSR引物,再加6μLMix(Mix:ddH2O=5:1)后放入PCR仪扩增(PCR扩增程序(如表2):94℃预变性 5min; 94℃35s,55℃30s,72℃40s(38个循环); 72℃延伸10min)产物放置4℃保存。
试剂 体积
DNA 2μL
SSR引物 2μL
5μLMix 5μL
ddH2O 1μL
表1 10μL的扩增反应体系
步骤 温度 时间
Step1 94℃ 5min
Step2 94℃ 35s
Step3 55℃ 30s
Step4 72℃ 40s(38个循环)
Step5 72℃ 延伸10min
表2 PCR扩增程序
1、2、2 扩增产物电泳及检测
扩增产物在 2% 的聚丙烯酰胺凝胶上进行分离,(称取8g琼脂糖,再加入400mL电泳液(TBE:H2O1:10)中),电压 130 V/cm,经染色(核酸染料)、显影后,拍摄SSR 谱带照片备存和数据分析。
1、3 SSR引物的筛选文献综述
采用SSR标记技术,根据所选的欧洲大麦的样品进行对引物的筛选,获得具有高度多态性的引物。
1、4 数据统计和统计方法
使用Excel软件记录51份大麦品系的SSR谱带照片中的DNA条带大小值。利用28对的引物构建大麦指纹图谱,记录扩增条带,用“1”和“0”分别来表示同一位置扩增片段的有或无。
参考薛华柏等[7]的方法来构建SSR 特征指纹数据表。利用筛选到的SSR引物对欧洲地区大麦品种进行指纹图谱的构建[8-10]。
1、5 数据分析
根据指纹图谱来分析大麦的遗传机制[11-12]。
2、结果与分析
2、1 SSR多态性分析
通过筛选,从多对引物中筛选到28对多态性好的引物(如表3所示),可在实验中得到多个多态性片段