1.1 样品采集
从牛蒡榨菜腌制厂,采取牛蒡腌制初期盐卤样品,装于灭菌玻璃瓶中,置于4℃冰箱保存备用。
1.2 培养基
培养基:酵母膏 5g、蛋白胨 3.75g、柠檬三钠 1.5g、氯化钠 50g、氯化钾 1g、琼脂 10g、硫酸镁(MgSO4·7H2O) 5g、蒸馏水500mL,PH 7.0,,121℃灭菌20min。
1.3 试剂与器材
试剂:PBS(0.1moL/L)、不同浓度的氯化钠溶液、PI染液、溴化乙锭、结晶紫、碘液、乙醇、番红、Loading Buffer、RCR Master Mix、引物27F(RV-M)、引物R1492(MB-47)、ddH2O、细菌基因组DNA快速提取试剂盒(上海捷瑞生物工程有限公司)、SanPrep柱式DNA胶回收试剂盒(上海生工生物工程)、TAE缓冲液。
器材:DHP-9052型恒温箱、EW-6000微型离心机、TGL-16G台式离心机、HZ-9310K恒温振荡器、UV-7504单光束紫外-可见分光光度计、BDAccuriC6流式细胞仪、TC-25/H型PCR仪、LDZX-50FBS立式压力蒸汽灭菌锅、GelX1520凝胶成像分析系统、DK-S24电热恒温水浴锅、DYY-6C型电泳仪、OLYMPUS显微镜、SW-CJ-2FB净化工作台。
2 试验方法
2.1菌株的培养
2.1.1 菌株的分离纯化
取样品原液100μL,采用逐级梯度稀释方法,将稀释液均匀涂布于含10%NaCl(w/v)的平板上。37℃,培养48h后,标记典型单菌落。挑取单菌落,用平板划线法在含10%NaCl(w/v)的平板上重复多次纯化传代后,挑取单一菌落进行菌体和菌落形态观察。
2.1.2 菌株的保藏
继续纯化传代3次后,配置相同成分培养基斜面,挑取单菌落转接于斜面,恒温培养48h后,置于4℃冰箱保藏、备用。
2.2革兰氏染色及菌体形态观察
用接种环取一滴水于载玻片上,后挑取少量单菌落与水均匀混合,形成薄菌膜。将无菌膜一侧的载玻片在酒精灯火焰的外沿通过两到三次,使细菌死亡并固定在载玻片上。待玻片冷却后,在玻片上滴加草酸铵结晶紫染液,以覆盖菌膜为宜,染色2min,用水小心清洗。滴加碘液,染色2min,水洗。滴加95%的乙醇,脱色30s后,水洗。滴加番红染液,染色3min,水洗。待晾干后镜检。在100*10倍油镜下观察菌体形态。
2.3 细菌基因组提取
挑取嗜盐细菌纯单菌落接入灭菌离心管,放入摇床中37℃,220r/min培养12h。取培养48h菌液,用上海捷瑞生物工程有限公司生产的细菌基因组DNA快速提取试剂盒,提取细菌基因组DNA。
取1mL培养48h后的混合菌液于1.5mL的离心管中,8000rpm,离心1min,弃上清。加入150μL TE悬浮细胞,加入8μL Lysozyme室温下酶解10分钟。向悬液中加入300μL Digestion Solution混匀;加入4μLRNase A混匀,55℃保温10分钟;再加入3μL Proteinase K,55℃保温20分钟源!自`优尔'文"论(文`网[www.youerw.com。先加入300μL Ext溶液,后加入300μL PB溶液,充分摇动混匀,12000rpm离心5min,溶液分成上下两层,细菌基因组DNA在下层溶液中。用1mL移液枪的枪头伸到下层,将含有DNA基因组的下层溶液全部转移到带有收集管的GenClean柱中。8000rpm离心GenClean柱1min,弃去收集管中的废液。向GenClean柱中加入500μL Wash Solution,8000rpm离心1min,弃去收集管中的废液,重复该操作一次。不向GenClean柱加入任何试剂,12000rpm离心1min,弃去废液。将GenClean柱放入洁净的1.5mL的离心管中,加入40μL提前预热到55℃的Elution Buffer,37℃静置2min,12000rpm离心1min。离心管中液体即细菌DNA组,放置于-20℃冰箱保存。
2.4 电泳检测细菌DNA基因组