2.2.2仪器设备

表2-1 仪器设备

Table 2-1 The instruments and equipments

仪器名称 型号 生产厂家或地址

高速冷冻离心机

超净工作台

电热恒温水浴锅

Eppendorf移液器系列

紫外分光光度计

超低温立式冰柜

掌上离心机

电子天平

制冰机

PCR仪

微波炉

荧光定量PCR仪

台式高速离心机

电泳仪

普通冰箱 3-18K

SW-CJ-1B

21-6

200uL,100uL,20uL,10uL

NANODROP 2000C

MDF-382E

WTL

BP211D

FM70A

GeneAmp® PCR System 9700

WD700

CFX96

1-13

DYY-12型

BCD-257SL SIGMA公司

苏州

江苏常熟

德国

GBC公司

日本三洋

中国

德国Sartorious

中国格兰特

美国应用生物系统公司

佛山格兰仕公司

美国Bio-Rad公司

SIGMA公司

北京六一

海尔

2.2.3 试剂

无水乙醇、DEPC-超纯水、RNAiso Plus(裂解液)、氯仿、NaCl、液氮、异丙醇、PCR定量试剂盒、琼脂糖

反转录CDNA试剂盒:①gDNA Eraser ②5*gDNA Eraser Buffer ③prime suipt RT Enzyne mirl ④5*prime suipt Buffer2(for real time) ⑤RT Prime mix ⑥RNase Free dH2O⑦Easy Dilution(for real time PCR)

2.3方法

2.3.1提取的各组织的总RNA[11,12]

(1) 向研钵、剪刀、镊子等沾取少量酒精点燃灭菌,加入液氮冷却。迅速加入适量山羊组织样品并不断倒入液氮至研磨成粉末。

(2) 加入1 mL的裂解液,盖上锡箔纸,静置30min。将样本移去1.5 mL EP管中,冰盒静置5 min。设置高速冷冻离心机温度为4℃,转速12,000 r/min,离心5min。

(3) 取出上清液移到EP管中,加入0.2mL氯仿,盖紧离心管,用力振荡15s,等到溶液充分乳化,称重配平,在冰盒静置5 min,离心16 min。

(4) 取出上清液到新管中,加入等量的异丙醇,充分混匀后称重配平。在23℃恒温锅水浴10min,最后离心10min。 

(5) 留下白色沉淀,顺着离心管徐徐加入1 mL 75%的乙醇,轻柔的洗涤离心管壁。离心5 min,弃去所有乙醇。

(6) 室温下干燥沉淀5 min,加入RNase-free dH2O,慢慢地用移液枪吹打,至沉淀完全溶解,放在-80 ℃冰箱中保存。

2.3.2  检测提取出的RNA的浓度

用紫外分光光度计(Cintra)来进行RNA浓度检测。使用后用超纯水洗涤3次。OD260/280值应该在1.8-2.0之间,假如R小于1.8则蛋白质可能被污染,大于2.2则RNA可能已经降解。同时,OD260/230 要大于2.0、小于2.4,假如低于2.0则裂解液中有机溶剂可能没有去除干净。如果实验结果不符合上述要求,要重新提取RNA。

2.3.3  RNA逆转录成cDNA

(1)反转录前,把DNA酶加入提取的RNA中,去除基因组的DNA。

(2)配置反应液:一般为了减少误差要做多组实验,反应液量配置要多于实际量。反应液的成分如下:②5*gDNA Eraser Buffer 2.0uL ;①gDNA Eraser 1.0 uL ; Total RNA 最多1ug ; ⑥RNase Free dH2O 加到10.0uL. 

(3)把反转录仪温度升到42℃,把配好的反应液静置2分钟。

(4)配置Master Mix:把参与反应的混合液配好放在冰上,我们要按多于反应数2的量配制Master Mix,然后等量分到反应管中。Master Mix溶液成分如下:③Prime Script RT Enzyne Mix 1.0uL ;⑤RT Prime Mix 1.0uL ; ④5xPrime Script Buffer2 4.0uL ; ⑥RNase Free dH2O 4.0uL ;

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