细胞色素酶P450基因芯片数据
Fig.1 The data of gene chip for cytochrome p450
2.材料与方法
2.1材料
用于克隆该酶系的母本为拟南芥基因组DNA,拟南芥种子有本实验室保存。遗传转化的受体植物本生烟(Nicotiana benthamiana)种子由中国农业科学院油料作物研究所提供,用于克隆以及载体构建的各材料均由本实验室购买和保存。
2.2 细胞色素酶启动子的克隆源-自/优尔+文,论`文'网]www.youerw.com
2.2.1 拟南芥总DNA的提取
以野生型拟南芥幼叶为材料,采用CTAB法提取基因组总DNA[7]。
2.2.2 引物设计
根据细胞色素酶P450基因(Genbank accession number: At1g01600)序列,设计并合成PCR扩增引物:
P1: 5’CGTTATGAGGCTTGCAGCACCGTGA3’
P2: 5’CTACGATCGGTAGCTCATAATTGTAACCCAGAGA3’
为了便于PCR产物后期的酶切连接,在引物P1/P2序列中分别加入了不同的酶切位点。
2.2.3 PCR扩增目标片段
在50 μL反应体系中分别加入1 μL拟南芥基因组DNA(50 ng)、5 μL dNTP(2mM)、2 μL MgSO4(25 mM)、1 μL引物(25 μM)和1 μL的KOD Plus高保真DNA聚合酶(1 U)。经94℃变性2min后,94℃30s,64-60℃(每个循环降0.5℃)30s,72℃ 2min15s 8个循环;94℃ 30s,60℃ 30s, 72℃ 2min15s, 25个循环;72℃延伸2min。1%琼脂糖凝胶电泳显示PCR产物和目的片断大小一致。
2.2.4 PCR产物纯化
在进行基因片段的酶切和连接之前,首先对PCR产物进行分离纯化,该过程使用PCR纯化试剂盒。纯化结束后,将其克隆到中间载体pZero++Amp上,然后转化到感受态大肠杆菌内进行扩繁。
2.2.5 阳性克隆筛选
将转化后的大肠杆菌阳性克隆进行PCR筛选,筛选体系(25µl体系)如下:
10×Taq酶Buffer(含(NH4)2SO4) 2.5µl
MgCl2 2 mM
dNTP 0.2 mM
P1/P2引物 各25pM
Taq酶 1 U
底物 菌体2.5µl(OD=0.8)
扩增后电泳检测PCR产物,和目标片段大小一致的克隆为阳性克隆,并将阳性克隆测序,确保功能基因已获得。