本研究以水稻品系为试验材料,分别采用定性及定量PCR方法,对CaMV35S启动子基因进行检测分析,来判断该水稻是否为含有转CaMV35S启动子基因的转基因产品。
2 材料与方法
2.1 材料
阳性质粒DNA(含有CaMV35S基因),待测样品为水稻颗粒均有由老师提供。
2.2 试剂与耗材
DNA抽提试剂盒、定性PCR用Taq酶、dNTP、MgCl2、定量PCR用2x GoldStar TapMan Mixture(with ROX)、电泳用DNA ladder maker均由康为世纪公司提供。定性及定量PCR引物、探针均由上海捷瑞生物工程有限公司合成。
2.3 仪器设备
普通PCR扩增仪、实时荧光PCR扩增仪、电泳槽及电泳仪等电泳装置、凝胶成像系统等。
2.4 方法文献综述
2.4.1 DNA的提取与纯化
操作步骤
1)将水稻颗粒使用美的搅拌机(MJ-BL25B2)粉碎成粉末状,称取 0. 2 g粉末装入液氮预冷的2mL离心管中,加入400μl Buffer GF1和4μlRNaseA(100mg/ml),涡旋振荡1分钟,使其充分裂解。
2)65℃孵育10分钟,期间涡旋混匀2~3次。
3)加入130μl Buffer GF2,混匀,冰上孵育5分钟。
4)将所得液体转移到已装入收集管的过滤柱中,14000rpm离心2分钟,收集滤液。
5)将收集管中收集到的滤液转移到一个新离心管中。
6)加入1.5倍体积的Buffer GF3 (使用前检查是否已加入无水乙醇),充分混匀。
7)将步骤6中所得溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱中,若一次不能加完 溶液,可多次转入,10000rmp离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放入收集管中。
8)向吸附柱中加入500μl Buffer GW(使用前检查是否已加入无水乙醇),10000rpm 离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
9)重复步骤8。
10)12000rpm离心2分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
11)将吸附柱放到一个新离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50~100μl Buffer GE或灭菌水,室温放置2-5分钟,10000rpm离心1分钟,收集DNA溶液。-20℃保存DNA。
2.4.2 引物序列 来~自^优尔论+文.网www.youerw.com/
根据引物合成的原则,通过使用引物合成软件,分别合成定性及定量引物,
引物序列详见下表。
2.4.3 PCR检测
1、定性PCR扩增
PCR是一种体外DNA 扩增技术,经过模板高温解链变性,引物退火结合到单链DNA和在酶的作用下引物延伸三个步骤,使得DNA片段在体外呈指数增加的实验技术,该技术能在短时间内获得大量特定的基因片段[8]。本研究根据实验室的一贯实验习惯,采用25ul反应体系进行PCR扩增