2 实验材料与方法
2.1土壤样品采集
实验器材:无菌保鲜袋。
采样于淮安农村的某麦田,随机选取几处采样点。选取小麦根部的土壤作为土壤样品。
2.2 制备土壤稀释液
实验器材:土壤样本、超纯水、无菌试管、无菌吸头、无菌三角瓶、摇床、电子天平。
实验过程:用电子天平秤取1.0g麦田土壤样品放入盛有99mL超纯水的无菌三角瓶中,放入摇床中震荡10min形成均匀的悬液。使用移液枪从三角瓶中吸取1mL土壤悬液,加入装有9mL超纯水的无菌试管中混合均匀,标记为10-1稀释液。再从该10-1稀释液的试管中吸取1mL液体,加入下一支装有9mL超纯水的无菌试管中混合均匀,标记为10-2稀释液。以此类推,获得10-1,10-2,10-3,10-4,10-5,10-6,10-7,10-8八个稀释梯度的土壤稀释液。文献综述
2.3 培养基与试剂
LB培养基(g/L):牛肉膏5.00g,蛋白胨10.00g,NaCl 10.00g,去离子水1000 mL,pH7.0~7.2,固体培养基加琼脂粉1.5 g/100 mL。
DNA电泳缓冲液TAE:配制50倍浓TAE(pH8.5),2 M Tris-醋酸,100 mM EDTA;电泳时或配制琼脂糖凝胶时用去离子水稀释至1倍浓TAE缓冲液。
菌株鉴定过程中用到的taq酶等分子试剂购自溥博生物科技(徐州)有限公司。
2.4 涂布培养
实验器材:涂布器、LB培养基
实验过程:将占有少量酒精的涂布器在火焰上灼烧30s,然后冷却8~10s。吸取50ml菌液,滴加到培养基表面。用涂布器将菌液均匀的涂布在培养基表面,涂布时转动培养皿,使涂布均匀。将涂布好的平板平放于桌上20~30min,使菌液渗透入培养基内,然后将培养基倒转,放入37℃温箱培养48小时,标注不同稀释浓度的培养基标号以便区分。
2.5 划线培养
实验器材:接种环、移液枪、移液管 、LB培养基
实验过程:将接种环放置于火焰上灼烧至发红,然后在火焰旁冷却接种环。将已冷却的接种环伸入菌液中,沾取一环菌液(过程中一定要注意防止菌液被杂菌污染)。左手将皿盖打开一条缝隙,右手将沾有菌种的接种环迅速伸入平板内,划五至六条平行线,盖上皿盖(注意不要划破培养基)。灼烧接种环,待其冷却后,从第一区域划线的末端开始往第二区域内划线。重复以上操作,在三区域内划线。注意不要将最后一区域内的划线与第一区相连。将平板倒置,放入培养箱中培养。
2.6 菌株16S r-DNA的扩增与序列分析
2.6.1 PCR扩增原理
以细菌的基因组DNA为摸板,采用通用引物扩增菌体的16S rDNA序列,引物正向序列:5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3',反向互补序列为: 5'-TTCAGCATTGTTCCAT-3'。
PCR反应体系(50μL)为:2×Taq聚合酶反应缓冲液25 µL,DNA模板1µL,Primer F (10µM) 1µL, Primer R (10µM) 1µL, 加无菌水至50 µL。
PCR扩增反应条件: 预变性95℃ 5 min; 变性94℃ 30 s,退火 54℃ 30 s,延伸72℃ 1.5 min, 30个循环;最后72℃延伸20min,降温至10℃保持5 min。
2.6.2 琼脂糖凝胶电泳
(1)称取0.75g的琼脂糖粉末,放到一锥形瓶中,加入100 mL 1×TAE电泳缓冲液。然后置于微波炉加热至完全溶化,溶液均匀透明。冷却至60℃左右,在胶液内加入适量的核酸染料Goldview。
(2)取制胶板槽,水平放置胶槽,在一端插好梳子,在槽内缓慢倒入已冷至60℃左右的胶液,使之形成均匀水平的胶面,凝胶厚度约为3~5 mm。
(3)待凝固后,小心拔起梳子,使加样孔端置阴极端放进电泳槽内。来`自^优尔论*文-网www.youerw.com