此次实验采用病毒学诱导基因沉默技术(VIGS),在本氏烟草系统中研究拟南芥基因的功能[18]。病毒诱导的基因沉默(virus induced gene silencing,VIGS)是指携带目标基因片段的病毒侵染植物后,可诱导植物内源基因沉默、引起表型变化,进而根据表型变异研究目标基因的功能[21]。VIGS是根据植物对RNA病毒防御机制发展起来的一种技术,其内在的分子基础可能是转录后基因沉默(post-transcript gene silence)。与传统的基因功能分析方法相比,VIGS能够在侵染植物当代对目标基因进行沉默和功能分析[19];可以避免植物转化;克服功能重复;可以在不同遗传背景下起作用,对基因功能分析更透彻[20]。因此,VIGS一经建立,即被视为研究植物基因功能的强有力工具,得到了深入的研究和广泛应用,已用于烟草、番茄等植物的抗病反应、生长发育以及代谢调控的功能基因研究。在植物基因组研究进入功能基因组的时代,建立快速鉴定目标序列或基因功能的技术平台已刻不容缓[21]。植物抗病性是植物的一种属性,植物对病原体的抗性可以通过诱导产生。病毒诱导基因沉默是植物抗病的可能机制,同时为功能基因组学的研究探索出一条有效的研究方法。文献综述
此次研究的是AT2G47610,AT2G47610基因编码的蛋白质是核糖体蛋白的成员,它参与翻译,并且参与核糖体的结构组成。该蛋白包含的结构域:核糖体蛋白L7A (InterPro:IPR001921)核糖体蛋白L7Ae / (InterPro:IPR018492)核糖体蛋白L7Ae / L30e / S12e。最匹配的拟南芥同源蛋白是核糖体蛋白L7Ae / L30e / S12e / Gadd45家族蛋白(TAIR AT3G62870。1)。AT2G47610的基因长度是744bp。基因序列如图:
1 材料与方法
1。1 实验材料以及设备
实验材料:实验材料取自种植的拟南芥拟南芥(Arabidopsis thaliana, ecotype Columbia)Col-0以及本氏烟草(Nicotiana benthamiana)进行实验操作。
实验相关分子生物学试剂:DNA聚合酶:LA taq(TAKARA公司产品),dNTP(TAKARA公司产品),引物(Invitrogen公司订购),10×LA taq buffer(TAKARA公司产品),限制性内切酶(NEB公司产品),RNA提取试剂盒(QIAGEN公司产品),凝胶回收试剂盒(QIAGEN公司产品),m7G(5')ppp(5')G RNA Cap Structure Analog(购自NEB公司,货号#S1404S),T7 RNA Polymerase(购自NEB公司,货号M0251S)。Ribonucleotide Solution Set (ATP, UTP, GTP, CTP均为100 mM)(均购自NEB公司,货号N0450S)。T4 DNA ligase(TAKARA公司产品),RNA酶抑制剂 (RNasin,Promega公司产品)。
实验室相关化学试剂:异丙醇(国药集团),无水乙醇(国药集团),氯仿(国药集团),氯化钠(国药集团),琼脂糖(Biowest Agarose,西班牙),蛋白胨(typtone,上海生工),酵母提取物(Yeast Extract Powder,上海生工),Agar B(上海生工),Ampicillin(Sigma公司产品),NaOH(国药集团),HCl(国药集团),酚:氯仿:异戊醇=25:24:1(solarbio公司产品),NaAc(醋酸钠,sigma公司产品),DuRed(北京泛博生物化学有限公司)。来,自,优.尔:论;文*网www.youerw.com +QQ752018766-
质粒载体:pMD19-T(TAKARA公司产品),PVX病毒侵染性克隆载体。
菌株:大肠杆菌感受态细胞DH5α。
实验室设备:温度梯度PCR仪(BioRad公司),凝胶成像仪(BioRad公司),Nikon单反相机(D5300),金属浴(Eppendorf公司),MiliQ超纯水系统(Milipore公司),高压灭菌锅(BioRad公司),低温离心机(Eppendorf公司),超低温冰箱(Thermo Fisher Scientific公司),超净台(苏州苏净),生物安全柜(Thermo Fisher Scientific), NanoDrop微量分光光度计(Thermo Fisher Scientific),控温摇床(Thermo Fisher Scientific),细菌培养箱(Thermo Fisher Scientific),烘箱(Thermo Fisher Scientific),核酸蛋白质电泳系统(BioRad),电子天平(METTLER TOLEDO)。