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在接下来的五十余年里，虚云陆续延承了禅宗五派法脉，为其成为禅门领袖逐步奠定基础，这对日益衰落的近代禅宗不可不说是一种力挽狂澜的作用，这也为后世禅宗的振兴埋下了种子。1892年，虚云在鼓山涌泉寺，作为妙莲和尚的法子，受持临济衣钵，按临济宗的龙池系法派计算，是四十三世，曾有偈说“觉性本常寂，心惟法界同。如缘宏圣教，正法永昌隆”。 同时又在耀成和尚座下承嗣曹洞宗法脉，为其第四十七世，留偈云“慧元道大兴，法界一鼎新。通天兼彻地，耀古复腾今。今日禅宗振，宏开洞上传。正中妙挟旨，虚融照独圆”。 1932年，福建长汀的青持明湛法师赴南华寺拜虚云为师，希望由虚云来振兴法眼一宗，虚云非常认可他的想法，于是查阅典籍，确定法眼的法脉只传承到七世，所以自己延续为第八世，留偈云“良虚本寂体无量，法界通融广含藏。遍印森罗圆自在，塞空情器总真常。惟斯胜德昭日月，慧灯普照洞阴阳。传宗法眼大相义，光辉地久固天长”。 1933年夏天在南华寺时，他受到湖南沩山的宝生长老和长沙的郭涵斋居士恳请，希望由他兴修大沩密印寺，并恢复沩仰法脉。虚云便查阅典籍，确定沩仰法脉共历七世，后无传承考据，于是自己遥承兴阳的词铎禅师法脉，续沩仰宗至第八世，又留有偈“词德宣衍道大兴，戒鼎馨遍五分新。慧焰弥布周沙界，香云普荫灿古今。慈悲济世愿无尽，光昭日月朗太清。振启拈花宏伪上，圆相心灯永昌明”。 1943年，长久以来，云门祖庭的法脉断断续续，他对此感到很痛惜，查阅资料，发现此宗到十一世的己庵深净禅师为止，之后没有典籍，所以自己延续本宗，为第十二世，并期待后辈贤人承续法脉，留偈云“深演妙明耀乾坤，湛寂虚怀海印容。清净觉圆悬智镜，慧鉴精真道德融。慈悲喜舍昌普化，宏开拈花续传灯。继振云门关一旨，惠泽苍生法雨隆”。 至此一身延承了禅门五宗法脉。虚云禅师一生致力于近代禅宗的振兴，被誉为“禅宗泰斗”，自度而度人，于1959年圆寂，世寿一百二十岁，戒腊一百零一。
二、虚云和尚禅学思想
虚云和尚一生修习禅定，对禅宗中禅学理论有着独到的见解，包括参禅的理论，对禅宗五派思想的把握，对禅宗和佛教其他宗派的关系，以及禅宗发展和经济活动的关系等，相关论述丰富，对当时禅宗的振兴有着莫大的激励，对后世禅宗的发展也有着深远的意义。
其一，参禅的目的是明心见性。
虚云强调参禅的目的，在明心见性，就是要去掉自心的妄想执着，参透自己的本来面目，所谓“明悟自心，澈见本性”。 虚云言“只为你我从无量劫来，迷沦生死，污染久了，不能当下顿脱妄想，实见本性”。 意思是在佛教，人有百千轮回与无量的劫数，在这样一段经历中，人逐渐被妄想和世间的尘劳缚著了心性，遮盖了本自光明的真如佛性。因此，要参禅，通过参禅来断掉诸多妄想，回归自性。而除妄想自然是参禅的先决条件，即首先要做到“万缘放下，一念不生”。 虚云更坦言“这两句话如果不做到，参禅不但是说没有成功，就是入门都不可能”。 至于如何做到呢？虚云谈及“上焉者一念永歇，直至无生，顿证菩提，毫无啰嗦”。 此是说有上等根器的人直接从一念未生处永远歇住，再也没有念头生起，便可以顿悟证得菩提，没有什么来来去去的方法。从某种程度上，可见虚云是把住了佛教的真理妙心，从而能直抵明心见性的本质。虚云又有云，“其次则以理除事，了知自性本来清净，烦恼菩提、生死涅槃皆是假名，原不与我自性相干……不应随一切幻事的生住异灭，而起欣厌取舍，通身放下，如死人一样，自然根尘识心消落，贪嗔痴爱泯灭”。 这是说其次的办法就是先明白一切幻事和自性本不相干的道理，然后再做放下万缘的参修，而后妄想也就自然地消失，不再起分别心或执著心，到这一步，也就是一念不生了。可见虚云不仅对禅法有着深刻的领悟，还能注重对机说法，随顺各人的根器，予以方便。至此虚云才言，“至是参禅的条件具备了，再用功真参实究，明心见性才有分”。 意思说做到万缘放下，一念不生，才具备了参禅的条件，再真实地用功参究，明心见性才有可能。可见虚云在禅学思悟上，能够不止于禅法禅境，把住其自性本原。