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蓖麻CKX基因家族生物信息学分析(3)
1.3.2 细胞分裂素氧化酶(CKX)种类
细胞分裂素氧化酶活性在各种组织和不同物种中已相继检测,如玉米、小麦、菜豆和蚕豆等。目前,已经鉴定出多个CKX基因。拟南芥有7个CKX基因(AtCKX1 ~ AtCKX7),其中AtCKX2 和AtCKX4同源性高,而AtCKX7的氨基酸与AtCKX中其它CKX成员的氨基酸的同源性很小[18]。水稻OsCKX基因至少有11个成员,玉米ZmCKX基因家族至少有13个成员。其中ZmCKX1 ~ AtCKX5均在玉米籽粒的早期发育过程中起作用。AtCKX家族成员的氨基酸序列同源性在34.3%~65.9%之间,而拟南芥AtCKX与玉米ZmCKX蛋白氨基酸序列同源性在34.5%~44.9% 之间。
1.3.3细胞分裂素氧化酶的生理功能
细胞分裂素氧化酶(CKX)能够催化天然细胞分裂素发生不可逆降解,同时也是降解内源细胞分裂素(Cytokinin,CK)的关键酶。每个CKX基因都有其特有功能,不同的CKX蛋白在亚细胞水平上定位不同。CKX定位在不同的亚细胞上,CKX活性不同,发挥的功能也不一样。CKX 是导致内源细胞分裂素水平下降的关键酶,很多研究发现过表达CKX 的转基因植株内源细胞分裂素水平与对照组相比明显下降[19, 20]。
1.4本研究的目的及意义
通过MEGA5.0、DNAMAN、NCBI等生物信息学
软件
对蓖麻CKX基因进行生物信息学分析,将CKX的功能了解得更加详细清楚,阐述CKX基因与其编码蛋白质的结构特征,将有助于蓖麻CKX基因的功能预测,为蓖麻CKX基因功能研究及果实发育的调控机制奠定基础,也能够对CKX的功能做一个大胆的预测。
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