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猪13号染色体影响猪产仔数的SNP鉴别(3)
根据二花脸猪高低产组重测序的结果,在RBP1基因的启动子上共鉴别到了7个SNP,外显子上鉴别到了1个SNP。其中外显子上的SNP为同义突变。在RBP1外显子区域,剔除最小等位基因频率<0.2的SNP位点,将LD值≥0.6视为连锁。经过以上条件质控后,启动子区剩余位点均显示连锁。因此,选择启动子区的13:88075242bp位点为候选研究SNP。
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