0。29 0。78 0。37

Trihelix9 Trihelix31 少量(14) 0。50 0。00 -

Trihelix11 Trihelix28 少量(12) 1。13 0。93 1。22

Trihelix11 Trihelix19 大量(341) 0。40 0。57 0。70

Trihelix10 Trihelix17 大量(341) 0。28 0。71 0。39

Trihelix19 Trihelix28 少量(13) 0。98 1。08 0。91

Trihelix30 Trihelix9 少量(15) 0。50 2。48 0。20

图 5  水稻Trihelix转录因子家族在染色体上的复制分析

Fig。5 The chromosome duplication analysis of rice Trihelix transcription factors members

每一条染色体的右侧显示的是染色体的物理位置(Mb);被标注在染色体的左侧的是水稻中所有的Trihelix基因,基因组进化过程中同源复制事件用直线连接表示;整条染色体的长度用mtm(1~12)来标注,复制的Trihelix基因用红色连线来显示。文献综述

3。1。5 Trihelix转录因子家族在水稻和高粱、水稻及短柄草之间染色体区段复制分析

    通过PGDD在线数据库分析发现,水稻里存在近三十个Trihelix基因和短柄草里的目标基因存在着线性同源关系(图6A),在水稻和高粱中进行染色体复制分析发现,有二十多个Trihelix基因存在着线性同源关系(图6B)。推测这些基因在进化过程中经历了复制、重排和缺失等一系列进化事件。

图 6  Trihelix基因在水稻和二穗短柄草、水稻和高粱中的染色体线性复制分析

Fig。6 The chromosome synteny and replication of Trihelix genes in rice and Brochypodium distachyon,rice and sorghum,respectively

A:Trihelix基因在水稻和二穗短柄草基因组中的染色体线性复制分析 (水稻染色体用R1~R12来表示,二穗短柄草染色体用B1~B5来表示);B:Trihelix基因在水稻和高粱基因组中的染色体线性复制分析 (水稻染色体用R1~R12来表示,高粱染色体用S1~S10来表示)。发生复制的Trihelix基因则用黑色连线来显示。来`自+优-尔^论:文,网www.youerw.com +QQ752018766-

3。1。6 Trihelix转录因子家族在水稻不同组织中的表达模式分析

   通过分析芯片数据,获得水稻不同组织中有27个Trihelix因子存在表达,分析Trihelix基因的表达结果,我们发现,水稻不同组织的整个生长阶段都存在能表达的转录因子。依据各自在水稻组织中的整体表达情况将他们分成7个亚类,不同的亚类提示其具有相似的表达谱变化。从表达谱的分析结果可以看出,第7亚类的Trihelix28、11、19和12在叶片、生殖根和穗中的表达量较低,在雌蕊、外稃和内稃中表达相对较高;第5亚类的Trihelix20、2和30在不同开花时间阶段的胚乳中具有较高的表达,在其他组织中表达相对较低或者不表达(图7);第5亚类的Trihelix20、2、30、9和1在叶片、叶鞘、根和茎中表达相对较低,在子房、胚和胚乳中表达相对较高,其他表达不是特别明显的亚类基因则分布的相对分散。

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