1。3位点选择:基于Hapmap数据库(http://hapmap。ncbi。nlm。nih。gov/)获得ADCY3基因组遗传变异资料,使用Haploview软件的Tagger功能,按照在中国人群中最小等位基因频率大于5%,且与该区段内其他SNP的连锁不平衡系数均大于0。8的原则,来筛选其Tag SNP。最终共获得了12个Tag SNP。筛选获得的12个位点及其相关信息详见表1。
1。4实验室检测:由上海捷瑞生物工程有限公司的相关人员负责DNA抽提和SNP分型检测。其中,DNA提取使用酚-氯仿法,SNP分型检测使用连接酶检测反应技术(ligase detection reaction,LDR)。实验所用的探针序列和引物详见表1。
实验过程如下:①PCR扩增:采用东胜EDC- 810PCR仪进行,扩增体系为DNA样本1μl,10×PCR 缓冲液1。5 μl,25 mmol/L MgCl2 1。5 μl,10mmol/L dNTP 0。3μl,10pmol/μl PCR引物每条0。15 μl,5U/μl Taq酶0。3 μl,加ddH2O至15 μl。扩增条件包括:首先94℃变性3min;其次94℃ 15s,55℃ 15s,72℃ 30s,循环35次;最后72℃退货火延伸3min。②测序反应:采用东胜EDC-810PCR 仪进行连接反应,连接反应体系为PCR 产物3 μl,加10×Taq DNA 连接酶缓冲液1 μl,Taq DNA 连接酶5 U,10 pmol/L 探针每条0。01 μl,加ddH2O至10 μl。连接反应条件包括94℃ 30s,56℃ 3min,循环30次。连接反应结束后取1 μl连接产物,8 μl上样缓冲液,95℃变性3min后立即冰水浴,上ABI3730XL测序仪测序。文献综述
1。5数据统计和分析:采用SPSS22。0软件进行数据分析,包括:①描述性统计分析:计数资料以频数和构成比表示,不符合正态分布的计量资料以中位数(四分位数间距)表示;②单因素分析:采用χ2检验比较对照组病和例组之间的计数资料差异;采用Peasonχ2检验比较在研究人群中的各多态位点基因型分布是否符合 Hardy-Weinberg平衡定律;采用非参数检验对血压和血脂水平进行比较分析;采用χ2检验比较两组人群ADCY3基因各位点基因型分布间的差异;③多因素分析:在单因素分析的结果基础上,采用多因素Logistic回归分析的方法分析ADCY3基因各多态位点与冠心病的关系,计算调整了年龄、性别等相关因素后的OR值及其95%CI。以P < 0。05来表明其差异有统计学意义。④叉生分析:在单因素分析的结果基础之上,用筛选出的相关环境因素与ADCY3基因型的隐性模型作为交互项,于多因素Logistic回归模型中分别进行叉生分析,计算调整了年龄、性别等相关因素后的OR值及其95%CI。以P < 0。05表明其差异有统计学意义