不同来源大豆种质对细菌性斑点病抗性研究(3)
级别 表观描述
1 叶片无病斑或仅散生少量局限型褐色斑点，直径0.5mm左右，病斑占叶面积1%以下
3 病斑散生，较多局限型或不规则型斑点，直径1mm左右，占叶面积1%～5%
5 病斑散生，不规则型斑点，直径2mm，占叶面积6%～10%
7 病斑不规则，扩展相连呈小片坏死斑，占叶面积10%～25%
9 病斑扩展，大块连片，占叶面积26%以上，叶片枯萎死亡
不同材料的抗性等级由感病度的平均值 划分：高抗为1.0，抗为1.0< ≤3.0，中抗为3.0< ≤5.0，感为5.0< ≤7.0，高感为 >7.0。
1．2．3关联分析方法
分子标记数据来自大豆50k SNP芯片基因分型结果(http://www.soybase.org/ snps/index.php)。按稀有等位变异频率MAF>5%筛选SNP标记，最终获得31045个SNP用于分析。使用GAPIT中MLM_PCA+K模型进行全基因组关联分析[9]，PCA矩阵为主成分结构矩阵，K矩阵为亲缘系数矩阵，显著性水平为-log10P≥3。进一步根据关联SNP标记筛选出稳定表现的QTL。以-log10P≥3作为显著性水平，将全基因组关联分析得到的标记比对Song等（2010）发表的大豆公共图谱，得到其遗传位置，以5 cm以内为标准定义为一个QTL位点[10]。
2 结果与分析
2．1 大豆种质接种细菌性斑点病S1菌株的症状反应
田间发病情况表明，大豆细菌性斑点病发生普遍，复叶表现多为水浸斑或褐色坏死斑，周围有褪绿晕圈，病斑直径为3 ～ 4 mm。不同级别抗性反应的症状特点明显，抗感品种差异明显