基于SSR的不同群体鳜遗传多样性初步研究
毕业论文关键词：鳜；不同群体；微卫星标记；遗传多样性
Analysis of genetic persity in six populations of Siniperca Chuatsi based on SSR
Abstract：Ten microsatellite markers were used to analyze the genetic structure in six populations of Siniperca Chuatsi. In each population, the average of allele value was from 2.2000 to 2.5000, the average expected heterozygosity (He) value was from 0.6489 to 0.7289 and the average polymorphic information content (PIC) value was from 0.5614 to 0.6409. The genetic differentiation coefficient among the population (Fst) was 0.0606, and the gene flow (Nm) was 4.0151. These genetic statistics indicated a richer genetic persity in six populations, there were middle genetic differentiation among these six populations and strong gene exchange among them. Same loci were found to be deviated from Hardy-Weinberg Equilibrium in each population, and it indicated that the deficiency of heterozygote existed in six populations. The UPGMA clustering showed that dangtu population formed an independent cluster，the other five populations were another cluster.
Key words: Siniperca chuatsi ；different populations；microsatellite marker；genetic persity
目 录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言1
1材料与方法2
1.1实验材料 2
1.2方法 2
1.2.1微卫星引物合成2
1.2.2基因组DNA提取3
1.2.3 PCR扩增及产物电泳检测3
1.2.4数据处理和分析4
2结果与分析4
2.1微卫星引物筛选及PCR结果4
2.2遗传多样性分析5 2.3 Hardy-Weinberg平衡分析5 2.4群体遗传结构分析6 3讨论 6
3.1群体遗传多样性分析6
3.2群体Hardy-Weinberg平衡检测7
3.3群体间遗传分化7
3.4关于等位基因数7
致谢8
参考文献8
基于SSR的不同群体鳜遗传多样性初步研究
鳜鱼（Siniperca chuatsi）俗称鳜花鱼、桂鱼、石桂鱼、季花鱼等，隶属硬骨鱼纲（Osteichthyes），鲈形目（Perciformes），鮨科（Serranidae），鳜亚科（Sinipercinae），主要分布在我国东部各大水系，以及俄罗斯远东地区、日本、朝鲜半岛和越南等地[1]。鳜鱼是我国著有的名贵淡水鱼类，肉质细嫩，刺少肉多，道鲜美，营养价值丰富，深受人们的喜爱[2]。
上世纪80年代中期开始，鳜鱼养殖规模不断扩大，产量迅速提高。近年来，因为过 度捕 捞以及水 域环境恶 化等原 因，鳜种质资源退化[3]。因此，对鳜展开遗传多样性研究，显得极 为重 要。目前，在分子水平研究鳜鱼遗传多样性的方法主要有RAPD标记技术和微卫星标记技术。杨受保等[4]采用RAPD技 术，对万 佛湖、长 江、秋 浦河3个不同鳜群 体开展了研究，发现其群 体内遗 传相 似系数分 别为0.8931、0.8839、0.9063，该结果说明鳜长 江群体的遗 传多样性比其 他2个地区的要高。方展强等[5]采用RAPD技 术，对来自鄱 阳湖的野 生鳜和南海省级鳜鱼良种场的养殖鳜进行了研究，发现两者的群 体内遗 传相似系 数分别为0.8547和0.9527，野 生鳜 群体的多 态位 百分 率为85.75 %，养 殖鳜群 体的为16.39 %，显而易见，鄱阳野生鳜的遗传多样性比南海养殖鳜的要高。