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利用VIGS方法分析TaJRL29的抗赤霉病功能(3)
1.1.2 溶液及培养基的配制 LB培养基:蛋白胨1%,酵母粉0.5%,NaCl 1%,ddH2O定容,121℃灭菌20min。固体培养基加1%琼脂,抗性培养基加对应的抗生素。保存于4℃冰箱。
土豆(马铃薯)培养基:土豆(洗净,去皮)200g,葡萄糖20g,琼脂15-20g,过滤之后ddH2O 定容至1000mL,121℃灭菌20min,保存于4℃冰箱。
绿豆培养基:绿豆65g,煮沸5min,定容1200mL,121℃灭菌20min,保存于4℃冰箱。
质粒提取液:P1:25mL 1mol/L Tris-HCl,10mL 0.5mol/L EDTA,定容至500mL,调PH=8.0,121℃灭菌20min,并加入RNase(1mg/μL)。P2:0.4mol/L NaOH,2% SDS按体积比1:1混合,现用现混合。P3:57.5mL CH3COOH,147.225g CH3COOK,定容至500mL,调PH=5.5,121℃灭菌20min。
TBE(5×)缓冲液:54g Tris碱,27.5g硼酸,20ml 0.5mol/L EDTA(PH=8.0),ddH2O定容至1L,常温保存。
SDS提取缓冲液(DNA提取液):0.1 mol/L Tris-HCl(PH=8.0),0.05mol/L EDTA(PH=8.0),1.25% SDS,0.5mol/L NaCl,3.8g/L亚硫酸氢钠定容。
70%乙醇:70mL无水乙醇加入ddH2O定容至100mL。
CaCl2:0.1mol/L,1.11g CaCl2固体加ddH2O配成100ml水溶液,121℃灭菌20min后4℃保存。
DEPC(焦碳酸二乙酯)水:0.1%,吸取1mL DEPC,ddH2O定容至1000mL,利用磁旋搅拌机充分混匀(30min),121℃灭菌40min,室温避光保存。
FES缓冲液:glycine 50mM,K2HPO4 30mM,Na4P2O7 1%,bentonite 1%,celite1 %,DEPC水定容,121℃灭菌20min,常温避光放置。
1.2 试验方法
1.2.1 RNA的提取与反转录 取开花期望水白(WSB)和中国春(CS)的各组织提取RNA,提取方法参照Invitrogen公司Trizol试刑产品说明书。将材料在液氮中充分研磨,然后加入到含1ml Trizol试剂的1.5ml离心管中,充分振荡混勾,室温放置5min,4℃12000rpm离心5min。取上清中加入等体积酚/氯仿充分混匀,4℃12000rpm离心15min。取上清用酚/氯仿抽提两遍,然后把上方无色水相转移到新的1.5ml离心管中,用两倍体积无水乙醇沉淀RNA,室温放置l0min后,12000 rpm离心l0min,去上清,用75%乙醇将沉淀的RNA清洗2次。室温干燥后,将沉淀溶于适量DEPC水中-80℃保存。在RNA充分溶解后。取2μL RNA样品在1%的琼脂糖凝胶上电泳检测质量。用紫外分光光度计(Ultrospec 2100 pro Amersham Pharmacia England)测定A260/A280值,估计样品浓度。
参照Promega公司反转录试别盒说明书进行反转录。取3μg RNA, 1 μ1 Oligo d (T),适量的DEPC水混匀后,65℃温育5min后迅速置于冰上,然后加入4μ1 5×第一链合成缓冲液,1μl 10mM dNTP混合液,1μl RNase,l00U M-MLV反转录酶和适量的DEPC水,调整至总体积为20μ1。在37°C下温育90min,最后70℃加热15min终止反应,-20℃保存以备用。
1.2.2 植物基因组DNA的提取 取适量植物叶片,放入2.0mL的离心管中,液氮速冻,用磨样器迅速研磨成粉末,加入预热的SDS提取缓冲液600μL,温和混匀。65℃水浴30min,水浴过程中每隔 10 min上下颠倒混匀一次。水浴后的样品12000rpm,4℃,离心4min后,将上清移入另一离心管中,加入等体积氯仿/异戊醇(体积比为24:1),上下颠倒混匀10min。12000rpm,4℃,离心 10 分钟,将上清移入另一离心管中,加入1.5倍体积冻酒精(-20℃预冷),轻轻混匀,12000rpm,4℃,离心6分钟,弃上清。加入1mL 70%乙醇洗涤,12000rpm,4℃,离心5min,倒掉上清液,风干沉淀,加入适量ddH2O溶解备用。
1.2.3 大肠杆菌DH5α感受态的制备 从37℃培养10-12h的平板中挑取一个单克隆菌落,转到一个含有100mL LB培养基的1L三角瓶中,于37℃,220rpm的条件下培养约3h(OD600≈0.5)。将菌液转移到一个无菌并用冰预冷的50mL的聚丙烯管中,在冰上放置10min,4000rpm,4℃离心15min,去上清。加入10mL预冷的CaCl2溶液,轻悬浮菌体,冰上放置10min后,4℃,4000rpm离心15min,弃上清,加入10mL预冷含15%甘油的0.05mol/LCaCl2溶液,轻轻悬浮细胞,即制成感受态细胞悬浮液。分装为100μL/管,保存于-80℃备用。
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