事实上,弄清了这一环节之后,将更有利于我们来控制自杀回路,并对自杀基因回路进行优化,实现对细菌自杀基因回路的人为可控化。在理论上,这将有助于在合成生物学领域构建自杀基因元件,促进合成生物学的发展。这不仅对继续探究细菌自杀行为本身有着重要意义,而且更有着巨大的应用价值。美国哈佛大学医学院教授Church等成立LS9可再生石油公司,利用合成生物学技术生产生物柴油,Zhang等人进行了生产能源物质氢的工作并都获得了较大进展。Lingchong You 等设计的对菌体密度敏感的调控网络实现对大肠杆菌生长密度的调控,从而导致细菌死亡,以此来代替药物治疗疾病,这对抗生素治疗日益泛滥的今天,有着深远的意义。
2.    材料与方法
2.1.    材料与仪器设备
2.1.1.    菌种
表2-1.实验中的菌株及质粒
Table2-1 Bacterial strains and plasmids used in this study
菌株    质粒    相关特点    来源或参考
Top10F'    pPopctrl1(见图2-1)    Kmr    实验室提供
117    pLuxGFPuv2(见图2-2)    Kmr    实验室提供
 图2-1 菌株Top10F'质粒
Fig 2-1 Plasmid of strain Top10F'
图2-2 菌株117质粒
Fig 2-2 Plasmid of strain117
2.1.2.    实验材料
此次实验主要购买的试剂及厂家情况见表2-2。
表2-2 实验试剂
实验试剂    厂家
LB液体培养基、LB固体培养基    生工生物有限公司
KCl
二甲基甲酰胺(DMF)
X-Gal粉末
2×Taq酶PCR混合液    金山县化工厂
生工生物有限公司
生工生物有限公司
生工生物有限公司
Biowest Agarose regular    GENE TECH(SHANGHAI)COMPANY LIMITED
胰蛋白胨    美国BD公司
卡那霉素粉末    生工生物工程(上海)有限公司
FastAP,Tango Buffer    生工生物工程(上海)有限公司
乙醇    国药集团化学试剂有限公司
AatII,Tango Buffer
HindIII,Tango Buffer
T4 DNA Ligase,T4 DNA Ligase Buffer    生工生物工程(上海)有限公司
生工生物工程(上海)有限公司
生工生物工程(上海)有限公司
50×TAE电泳缓冲液贮存液    生工生物工程(上海)有限公司
小剂量质粒提取试剂盒    生工生物工程(上海)有限公司
小剂量质粒提取试剂盒    上海杰瑞生物工程有限公司
小剂量凝胶DNA回收提取试剂盒    上海杰瑞生物工程有限公司
SK2301一步制备感受态细胞溶液SSCS    上海生工生物工程技术服务有限公司
2.1.3.    主要仪器和设备
实验室所需要用到的仪器及厂家信息见表2-3。
表2-3 主要仪器和设备
仪器和设备    厂家
10μL、200μL、1000μL微量移液枪    GILSON公司
GZX-9070 MBE数显鼓风干燥箱    上海博讯实业有限公司医疗设备厂
BOSCH超低温冰箱    博西华家用电器有限公司
电泳仪    北京百晶生物技术有限公司
pHS-3C 型pH计    上海精密科学仪器有限公司
HWS12型电热恒温水浴锅    上海恒科仪器有限公司
THZ-98A型恒温振荡培养箱    上海一恒科技有限公司
二氧化碳能培养箱    上海一恒科技有限公司
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